15 Temmuz 2016 yılında gerçekleştirilen askeri darbe girişimi sonrasında kararlaştırılan 667 sayılı Kanun Hükmünde Kararname doğrultusunda "milli güvenliğe tehdit oluşturduğu tespit edilen Fethullahçı Terör Örgütüne (FETÖ/PDY) aidiyeti, iltisakı veya irtibatı belirlenen" kurumlar arasında yer aldığı gerekçesiyle kapatıldı.
Üniversitenin kapatılmasının ardından FETÖ/PDY operasyonları kapsamında 38 kişi gözaltına alınarak tutuklanmıştı. Samsun Ticaret Sanayi Odası Davut Altan Meclis Toplantı Salonu’nda dün yapılan toplantıya katılan OMÜ Rektör Vekili Prof. Dr. Mehmet Kuran, Canik Başarı Üniversitesi’nde Amerikalı bir öğretim görevlisinin 14 Temmuz'da odasını toparlayıp ülkeyi terkettiğini söyledi. 15 Temmuz’da yaşanan darbe girişimini Amerika’nın organize ettiğini söyledi.